Na het veiligheidsonderzoek stellen de onderzoekers een verslag op dat ze naar de bevoegde veiligheidsoverheid sturen, die definitief beslist over het toekennen of weigeren van de veiligheidsmachtiging.
In de regel is dat de Nationale Veiligheidsoverheid (NVO), een dienst die is ingebed in de Veiligheid van de Staat.
Als de veiligheidsmachtiging echter betrekking heeft op een persoon die werkt binnen de Veiligheid van de Staat of zich kandidaat stelt voor een functie binnen die dienst, beslist de administrateur-generaal van de Veiligheid van de Staat om de machtiging al dan niet te verlenen. Wanneer de betrokkene ressorteert onder de minister van Landsverdediging of solliciteert voor een betrekking bij dit ministerie is het diensthoofd van de Algemene Dienst Inlichting en Veiligheid (ADIV) hiervoor bevoegd.
De veiligheidsmachtiging is in principe vijf jaar geldig. De veiligheidsoverheid kan echter de duur van de machtiging beperken. Voor het einde van deze periode zal een nieuw veiligheidsonderzoek worden uitgevoerd indien de betrokkene de machtiging nog nodig heeft.
Het is ook mogelijk dat de inlichtingendienst vóór het einde van de periode bepaalde aspecten van het privéleven van de betrokkene controleert.
Indien nodig kan deze dienst de veiligheidsoverheid aanbevelen om de machtiging vóór het einde van de periode in te trekken of ze tijdelijk te schorsen in afwachting van verder onderzoek